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(19)国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111653681.8 (22)申请日 2021.12.3 0 (71)申请人 深圳晶泰科技有限公司 地址 518000 广东省深圳市福田区福保街 道福保社区红柳道2号顺丰工业厂房3 层 (72)发明人 林泓叡 徐旻 杨立君 (74)专利代理 机构 北京中知君达知识产权代理 有限公司 1 1769 专利代理师 黄启法 (51)Int.Cl. G16C 20/50(2019.01) G16C 20/64(2019.01) G06K 9/62(2022.01) (54)发明名称 化合物分子成药性改良方法、 装置、 设备及 存储介质 (57)摘要 本申请涉及一种化合物分子成药性的改良 方法、 装置、 设备及存储介质。 该方法: 获取先导 化合物分子, 按照预置切片规则对 先导化合物分 子进行切片, 得到基于先导化合物分子对应的所 有化学环 境和可替换的分子片段组合, 基于化学 环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规 则, 根据取代规则对分子片段进行替换, 生成多 个候选化合物分子, 其中匹配分子对 数据库包含 多条取代规则, 每一取代规则均是关于ADMET成 药性的变化方向, 按照预置规则对多个候选化合 物分子进行筛选, 得到多个目标化合物分子。 由 于匹配分子对数据库包含的取代规则是关于 ADMET成药性的变化方向, 因此能够模仿药化专 家的设计思路, 对化合物分子的成药性进行改良 优化。 权利要求书2页 说明书10页 附图4页 CN 114512199 A 2022.05.17 CN 114512199 A 1.一种化 合物分子成药性的改良方法, 其特 征在于, 包括: 获取先导化合物分子; 对所述先导化合物分子进行切片、 识别, 得到基于所述先导化合物分子对应的所有化 学环境和可替换的分子片段组合; 基于所述化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规则, 根据 所述取代规则对 所述分子片段进行替换, 生成多个候选化合物分子, 其中所述匹配分子对数据库包含多条 所述取代规则, 每一所述取代规则均是关于ADM ET成药性的变化方向; 按照预置规则对多个所述 候选化合物分子进行筛 选, 得到多个目标化 合物分子 。 2.根据权利要求1所述的方法, 其特征在于, 所述分子片段包括氢原子、 官能团或化学 骨架; 所述基于所述化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规则, 根据所述取代规 则对所述分子片段进行替换, 生成多个候选化 合物分子, 包括: 基于所述化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规则, 根据 所述取代规则对 所述氢原子、 所述官能团或所述 化学骨架进行替换, 生成多个候选化 合物分子 。 3.根据权利要求1所述的方法, 其特征在于, 所述按照预置规则对多个所述候选化合物 分子进行筛 选, 得到多个目标化 合物分子, 包括: 基于所述ADMET成药性的数值大小对多个所述候选化合物分子进行排序, 根据多个所 述候选化合物分子的排序结果完成对多个所述候选化合物分子的筛选, 得到多个所述目标 化合物分子 。 4.根据权利要求1至3中任意一项所述的方法, 其特征在于, 所述匹配分子对数据库的 构建, 包括: 获取多个样本化 合物分子; 按照预处理方法对多个所述样本化合物分子进行清洗, 得到多个样本初始化合物分 子; 对多个所述样本初始化 合物分子进行切片; 以不同化学半径识别切片后的多个所述样本初始化合物分子对应的所有样本化学环 境和可替换的样本分子片段组合; 将所述样本化学环境相同的两个样本初始化合物分子进行配对, 基于两个配对好的所 述样本初始化合物分子计算出ADMET成药性的变化方向, 建立出所述样本分子片段的取代 规则, 重复此过程直至完成对所有所述样本初始化合物分子的配对, 构建出所述匹配分子 对数据库。 5.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述按照预处理方法对多个所述样本化合 物分子进行清洗, 得到多个样本初始化 合物分子, 包括: 滤除掉所述ADM ET成药性数值 为空的所述样本化 合物分子; 根据预置类药规则对保留下来的多个所述样本化合物分子进行挑选, 得到多个预处理 样本化合物分子; 以典型SMILES的方式表示多个所述预处理样本化合物分子, 并对多个预处理样本化合 物分子进行去重, 得到多个样本初始化 合物分子 。 6.根据权利要求5所述的方法, 其特征在于, 所述根据预置类药规则对保留下来的多个权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114512199 A 2所述样本化 合物分子进行挑选, 得到多个预处 理样本化 合物分子, 包括: 根据类药五规则对保留下来的多个所述样本化合物分子进行挑选, 得到多个预处理样 本化合物分子 。 7.根据权利要求4所述的方法, 其特征在于, 所述对多个所述样本初始化合物分子进行 切片, 包括: 以切除单键为主、 切除末端官能团及不超过最大切片次数的方式对多个所述样本初始 化合物分子进行切片。 8.根据权利要求7 所述的方法, 其特 征在于, 所述 不超过最大切片次数等于 3。 9.一种化 合物分子成药性的改良装置, 其特 征在于, 包括: 获取模块, 用于获取 先导化合物分子; 切片识别模块, 用于对所述先导化合物分子进行切片、 识别, 得到基于所述先导化合物 分子对应的所有化学环境和可替换的分子片段组合; 匹配取代模块, 用于基于所述化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规则, 根据所述取代规则对所述分子片段进行替换, 生成多个候选化合物分子, 其中所述匹配分 子对数据库包 含多条所述取代规则, 每一所述取代规则均是关于ADM ET成药性的变化方向; 筛选模块, 用于按照预置规则对多个所述候选化合物分子进行筛选, 得到多个目标化 合物分子 。 10.根据权利要求9所述的装置, 其特征在于, 所述分子片段包括氢原子、 官能团或化学 骨架; 所述匹配取代模块, 用于基于所述化学环境匹配出匹配分子对数据库中对应的取代规 则, 根据所述取代 规则对所述氢原子、 所述官能团或所述化学骨架进 行替换, 生成多个候选 化合物分子 。 11.根据权利要求9或10所述的装置, 其特 征在于, 所述筛选模块, 用于基于所述ADMET成药性的数值大小对多个所述候选化合物分子进 行排序, 根据多个所述候选化合物分子的排序结果完成对多个所述候选化合物分子的筛 选, 得到多个所述目标化 合物分子 。 12.一种电子设备, 其特 征在于, 包括: 处理器; 以及 存储器, 其上存储有可执行代码, 当所述可执行代码被所述处理器执行时, 使所述处理 器执行如权利要求1至8中任一项所述的方法。 13.一种计算机可读存储介质, 其上存储有可执行代码, 当所述可执行代码被电子设备 的处理器执行时, 使所述处 理器执行如权利要求1至8中任一项所述的方法。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114512199 A 3
专利 化合物分子成药性改良方法、装置、设备及存储介质
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