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(19)中华 人民共和国 国家知识产权局 (12)发明 专利申请 (10)申请公布号 (43)申请公布日 (21)申请 号 202111662814.8 (22)申请日 2021.12.31 (71)申请人 浙江大学嘉兴研究院 地址 314031 浙江省嘉兴 市秀洲区智富中 心48幢401室 申请人 浙江大学 (72)发明人 刘华锋 邱海祥 (74)专利代理 机构 杭州天勤知识产权代理有限 公司 33224 代理人 王琛 (51)Int.Cl. G06T 7/00(2017.01) G06T 5/00(2006.01) G06N 3/04(2006.01) G06N 3/08(2006.01) (54)发明名称 基于卷积神经网络的低剂量Sinogram去噪 与PET图像 重建方法 (57)摘要 本发明公开了一种基于卷积神经网络的低 剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其将重 建问题拆分成投影域去噪、 投影域到图像域重 建、 图像域去噪三个子问题, 分别用金字塔卷积 加权去噪模块、 改进的滤波反投影层、 改进的去 噪卷积神经网络解决; 金字塔卷积加权去噪模块 将低剂量的投影域数据Sinogram去噪, 生成接近 标准剂量的投影域数据, 滤波反投影层将频域滤 波器看作可学习的, 由去噪后的投影域数据 Sinogram重建含有噪声的重建图, 改进的DnCNN 去除重建图像中的少量噪声, 从而获得高质量的 重建图。 本发 明解决了深度学习用于图像重建时 难以解释的问题, 在低剂量的情况下, 依然能够 重建高质量的PET图像 。 权利要求书2页 说明书5页 附图2页 CN 114387236 A 2022.04.22 CN 114387236 A 1.一种基于卷积神经网络的低剂量Si nogram去噪与PET图像重建方法, 包括如下步骤: (1)获取模拟生成的正常剂量的Si nogram投影数据, 通过重建得到其对应的PET图像; (2)利用泊松分布对正常剂量的Sinogram投影数据进行降采样, 得到低剂量的 Sinogram投影数据; (3)根据步骤(1)和(2)获取大量样本, 每一样本包括低剂量的Sinogram投影数据、 正常 剂量的Si nogram投影数据及其对应的PET图像; (4)将PET重建问题拆分成以下三个子问题: 子问题1是一个Sinogram投影域去噪问题, 由低剂量的Sinogram投影数据经过神经网 络去噪, 生成接 近标准剂量的Si nogram投影数据Y1; 子问题2是一个重建问题, 由Sinogram投影数据Y1通过改进的滤波反投影算法(FBP)得 到含有少量噪声的PET重建图像X1; 子问题3也是一个去噪问题, 由PET重建图像X1经过神经网络去噪, 得到高质量的PET重 建图像X; (5)将所有样本划分成训练集和测试集, 搭建由去噪模块D1、 重建模块和去噪模块D2依 次连接组成的网络模型; 利用训练集样本中低剂量的Sinogram投影数据作为去噪模块D1的输入, 正常剂量的 Sinogram投影数据作为去噪模块D1输出的真值标签; 使去噪模块D1的输出结果作为重建模 块的输入, 正常剂量的Sinogram投影数据对应的PET图像作为重 建模块输出的真值标签; 使 重建模块的输出结果作为去噪模块D2的输入, 正常剂量的Sinogram投影数据对应的PET图 像作为去噪模块D2输出的真值标签, 从而对整个网络模型进行训练; (6)将测试集样本中低剂量的Sinogram投影数据输入至训练完成后的网络模型中, 重 建得到对应的PET图像, 使其与正常剂量的Si nogram投影数据对应的PET图像进行比较。 2.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 步骤(1)中采用OSEM重建算法对正常剂量的Sinogram投影数据进行重建, 得到其对应的PET 图像。 3.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 步骤(2)的具体实现方式为: 对于正常剂量的Sinogram投影数据, 首先利用Python内置库函 数基于泊松分布 生成与其Sinogram矩阵相同大小的随机数矩阵, 通过设置不同的归一化系 数, 可将随机数矩阵的均值设置成不同的大小, 进而通过矩阵点乘运算, 可让Sinogram矩阵 的均值变成原来的n分之一, 从而得到低剂量的Si nogram投影数据, n 为降采样的倍 率。 4.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 去噪模块D1采用金字塔卷积加权去噪模块, 其从输入至输出由7个卷积块依次连接组成, 所 述卷积块由一个pixel attention层和一个多尺度卷积层连接组成, 所述pixel attention 层由两个3 ×3的2D卷积层以及一个sigmoid激活函数连接组成, 所述多尺度卷积层分别采 用3×1、 1×3、 5×1、 1×5以及7×1、 1×7大小的卷积核进行卷积运算, 并将各卷积核的运算 结果拼接在一 起作为输出。 5.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 重建模块基于改进的滤波反投影算法, 包括频域滤波和反投影两部分, 其中反投影部分的 做法和传统滤波反投影算法一样, 而频域滤波部分则采用可学习的滤波器, 且每个角度的权 利 要 求 书 1/2 页 2 CN 114387236 A 2投影数据对应一个 独立的一维频域滤波器。 6.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 去噪模块D2采用改进的去噪卷积神经网络, 其 从输入至输出由8个2D卷积层和1个归一化层 依次连接组成, 每个2D卷积层都包含了64个3 ×3的卷积核, 除第8个卷积层外, 前7个卷积层 的输出都使用了激活函数ReLU和 批归一化BN处理; 进而将去噪模块D2的输入减去第8个卷 积层的输出, 然后通过归一 化层便可输出 得到高质量的PET重建图像。 7.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 所述 步骤(5)中对网络模型进行训练的具体过程如下: 5.1初始化网络模型的参数; 其中采用Kaiming去初始化去噪模块D1中的参数, 采用 Ramp滤波器去初始 化重建模块中的所有 频域滤波器, 采用截断正态分布去初始 化去噪模块 D2中的参数; 5.2将训练集样本中低剂量的Sinogram投影数据输入网络模型, 阶段1先训练50个 epoch, 使去噪模块D1收敛; 阶段2再训练50个epoch, 使重建模块收敛; 阶段3协同训练100个 epoch, 使整个网络模型收敛, 最后通过正向传播公式计算每层的输出, 进而获得网络模型 最终的输出; 5.3计算网络模型三个阶段输出与真值标签之间的损失函数: 其中: lossj为第j个阶段的损失函数, Xj(i)为对应第j个阶段第i个样本的网络模型输 出估计值, 为对应第j个阶段第i个样本的真值标签, N 为本阶段的训练样本个数; 5.4求损失函数的偏导数, 通过Adam算法更新网络模型中可 学习的参数; 5.5重复执行步骤5.2 ~5.4, 直到整个网络模型参数收敛。 8.根据权利要求1所述的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法, 其特征在于: 该方 法结合了传统的滤波反投影算法和卷积神经网络, 提出了一种可解释的深度神经网络结 构, 用于P ET图像重 建, 将重建问题拆 分成投影域去噪、 投影域到图像域重建、 图像域去噪三 个子问题, 分别用金字塔卷积加权去噪模块、 改进的滤波反投影层FBP、 改进的去噪卷积神 经网络DnCNN解决; 金字塔卷积加权去噪模块将低 剂量的投影域数据Sinogram去噪, 生成接 近标准剂量的投影域数据, 滤波反投影层将频域滤波器看作可学习的, 由去 噪后的投影域 数据Sinogram重建含有噪声的重建图, 改进的DnCNN去除重建图像中的少量噪声, 从而获得 高质量的重建图。权 利 要 求 书 2/2 页 3 CN 114387236 A 3
专利 基于卷积神经网络的低剂量Sinogram去噪与PET图像重建方法
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